盈江县卫生局是盈江县人民政府主管全县卫生工作的职能机构。人员编制26名。卫生局（含防艾办）下设办公室、医政股、防保股以及合管办4个股室。盈江县卫生局主要职责：
(一)贯彻执行党和国家有关卫生工作的方针政策、法规政令，结合实际拟订全县卫生管理工作规定和实施办法。
(二）根据县委、县政府对全县社会经济发展的总体规划和上级业务主管部门的要求，拟订全县卫生事业改革和发展的总体方案和中、长期发展规划、年度计划，并组织实施。
（三）贯彻预防为主方针，制定全县疾病防治规划并组织实施，负责预防和控制各种传染病、地方病，协助有关部门防治职业病。
（四）制定全县实现“人人享有卫生保健”目标的初级卫生保健规划和县级实施办法，协调有关部门，分步指导实施。
（五）组织开展妇女、儿童保健，防治危害妇女、儿童健康的疾病，提高妇女、儿童健康水平。
（六）贯彻《云南省中医发条例》，负责全县中医药行业的管理，发展中医药事业。
（七）制定农村卫生工作规划和政策措施，巩固和发展县、乡、村三级医疗防保网。
（八）加强对医疗机构体制改革的研究指导，运用法律、行政、经济等手段实行卫生工作全行业管理。
（九）研究制定全县区域卫生规划和卫生人才培养规划，统筹与协调全县卫生资源配置。
（十）根据管理权限，负责审批和管理社会医疗机构（单位），负责全县医疗卫生技术和质量的控制与管理。
（十一）负责全县医疗急救网的规划、建设，组织指挥各种突发事故的医疗救护以及对重大活动实施卫生保障。
（十二）负责卫生事业经费的申报和计划管理，组织实施内部审计监督；制定和申报防治设施及设备、技术计划，合理配置卫生资源。
（十三）贯彻执行国家、省、州卫生法律、法规和卫生规范标准，指导全县卫生监督工作。
（十四）根据云南省医疗卫生收费统一标准，审核各医疗卫生机构收费项目，并监督执行。
（十五）负责辖区内医疗卫生机构专业技术人员的专业技术职称评聘的考核、审查、申报和聘任管理工作。
（十六）负责管理全县医务人员执业注册登记、住院医师规范化培训工作。
（十七）依法监督管理食品卫生、劳动卫生、环境卫生、放射卫生、学校卫生。
（十八）依法监督管理县中心血库及临床用血质量和安全。
（十九）积极争取国际、国内对我县医疗卫生工作的各种项目支持，扩大我县卫生工作的对外合作与交流。
（二十）负责全系统思想政治工作、职业道德和法纪教育，纠正行业不正之风，组织在职人员再教育。
（二十一）负责抓好全系统的安全生产工作，督促检查各单位安全责任制的落实。
（二十二）负责全系统的党风廉政建设，抓好党的建设、班子建设、党员队伍建设。
（二十三）承担县地方病防治领导小组的日常工作。
（二十四）承担县爱国卫生运动委员会办公室的日常工作。
（二十五）承担县红十字会的日常工作。
（二十六）承担新型农村合作医疗的各项工作。
（二十七）承办县委、县政府和上级业务部门交办的其他工作。
目前，全县共有各类医疗卫生机构225个，其中：县直医疗卫生机构4个，乡镇卫生院16个（含2个分院），村卫生室165个（含67个分室），民营医疗机构28个（即：私立医院3个、综合门诊部3个、中医诊所2个、口腔诊所2个、普通诊所16个、厂矿医务室2个），农场卫生所4个，社区卫生服务中心4个，其它4个。全县共有卫生工作人员897人。全县共设有病床777张，每千人口拥有床位2.68张，农村卫生工作进一步加强。农村卫生室全部落实了“县办县管”的卫生管理体制。新型农村合作医疗工作稳步推进，社会效益初步显现，农民群众“看病难、看病贵”的得到缓解。城镇卫生体制改革不断深化。按照“盈江县2003-2010年区域卫生规划”，强化全行业管理和调整资源布局，卫生资源得到优化整合。医疗机构人事与分配制度改革进一步深化，建立起了有竞争、有约束、有活力的内部运行机制。坚持以人为本、科教兴医，人才队伍建设得到加强，人员素质不断提高。社区卫生服务体系不断完善，“小病在社区，大病到医院”的医疗卫生格局基本形成。